COVID-19病者的表现可以从的人会载有、轻症到需要呼吸机甚至游离膜肺氧合(ECMO)保有生命的危住院治疗病征,这其中都的极为极其重要决定性因素仍然有待破解。同时,新型冠状流感病毒到底在传递过程中都引发显着的遗传性,造成流感病毒毒力和传染性的发生变化,也急需进一步数据分析。
自传染病爆发之后,浙江大学自建苏州市公共预防临床该中都心(以下简称公卫该中都心)与转化医学发展中都国家实质性科技公共军事设施(苏州)(以下简称军事设施)、苏州血液学数据分析所、医学基因组学发展中都国家重点的实验室、瑞金医院临床流感病毒学的实验室,浙江大学苏州医学院分子流感病毒的实验室、苏州交通大学医学院自建同仁医院、中都科院植物生理生态数据分析所、苏州巴斯德数据分析所和苏州营养与身体健康数据分析所等单位协力,就新型冠状流感病毒基因组、分子霍乱学特点、性疾病临床构造开展了深入数据分析。
5月末20日,《Nature》杂志刊登了这一制作团队的最新数据分析结果。举例来说,公预防该中都心卢洪洲系主任与军事设施主任陈赛娟美国科学院领衔的联合攻关制作团队,收集了公卫该中都心在2020年1月末20日-2月末25日过后收治的326例病征标本,对流感病毒基因组表征、病症特点和免疫反应发生变化等数据开展了全面高度分析。
数据分析制作团队不断改进技术方法,高质量未曾完成了112例新冠流感病毒基因组测序、零件和二阶。他们基于流感病毒基因组核苷酸的趋同树分析辨认出,新冠流感病毒主要有两个主干(Clade I 和Clade II)。已确认有华南海鲜的产品沾染史的6例病征均集中都在其中都一个分枝中都(Clade I),而Clade II病征无该沾染史,指引COVID-19传染病的引发并不局限于华南海鲜的产品。
新冠流感病毒基因组趋同树
接着,通过对传染病暴发的各有不同时间前期和各有不同区域病征的新冠流感病毒基因核苷酸(截至2020年3月末初)表征构造的比较分析,从苏州病例分离出来的流感病毒基因组中都鉴别了169个氨基酸发生变化,其重复出现的突变与已定为的流感病毒核苷酸赞同,呈现较为稳定的趋同过程,指引该流感病毒可能在传染病早期就已适应在人类宿主中都传递。同时他们辨认出, 新冠流感病毒两个主干的传递性、致病性和病症等方面无显著歧异,未曾辨认出与COVID-19住院治疗病征有显著方面的流感病毒表征核苷酸。
COVID-19病者免疫细胞变化
数据分析人员从临床和免疫学数据分析辨认出,COVID-19病征免疫细胞显着下降,尤其是住院治疗病征CD4+和CD8+ T细胞呈显著开展性下降趋势,且炎性细胞特异性IL-6和IL-8显着增高。COVID-19性疾病发展严重程度的决定因素主要与病征年龄、基础性疾病及免疫细胞下降和方面的细胞特异性风暴密切方面,为性疾病向住院治疗背离的极为极其重要信号特异性。
这一数据分析结果意义不可忽视,对于进一步察觉到新型冠状流感病毒的分子霍乱构造、性疾病引发发展特性,为住院治疗病者早期病症和治疗,以及为药物和疫苗制造提供了极其重要的参考依据。
此外,数据分析制作团队还向中都国发展中都国家组学数据百科全书(The National Omics Data Encyclopedia,NODE) ()、亚太地区流感核苷酸数据库(GISAID)和NCBI的该协会核苷酸数据库(SRA)提请了112个病例的新冠流感病毒基因组高质量核苷酸数据。同时,军事设施也搭建了实质性性疾病大数据应用软件新冠流感病毒基因组数据交互式、开源在线分析网站()。国际上科研单位和科学研究均可完全共享方面数据分析数据。
早期出处:
Xiaonan Zhang, Yun Tan, Yun Ling, et.al. Viral and host factors related to the clinical outcome of COVID-19. Nature 20 May 2020
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